Так, Національне агентство працює у сфері розбудови доброчесності сектору безпеки та оборони, в тому числі, шляхом впровадження міжнародних стандартів та виконання рекомендацій НАТО, зокрема через співпрацю з міжнародними партнерами та координацію органів сектору безпеки та оборони, залучених до імплементації зазначених рекомендацій.

Управління проводить стратегічний аналіз корупційних ризиків у сфері безпеки та оборони з метою ідентифікації корупційних ризиків та надання рекомендацій щодо їх мінімізації; проводить антикорупційна експертизу проєктів нормативно-правових актів у сфері безпеки та оборони, що вносяться на розгляд Верховної Ради України або Кабінету Міністрів України та надає методичну допомогу орган сектору безпеки та оборони щодо виявлення корупційних ризиків у своїй діяльності та реалізації ними заходів щодо їх усунення.